Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC33Q8N5R6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC33Q8N5R6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC33Q8N5R6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC33Q8N5R6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC33Q8N5R6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC33Q8N5R6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC33Q8N5R6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms