Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYD2

KLHDC8A, Kelch domain-containing protein 8A, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8AQ8IYD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KLHDC8AQ8IYD2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHDC8AQ8IYD2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHDC8AQ8IYD2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHDC8AQ8IYD2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHDC8AQ8IYD2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHDC8AQ8IYD2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms