Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6K3

PTAR1, Protein prenyltransferase alpha subunit repeat-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAR1Q7Z6K3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTAR1Q7Z6K3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PTAR1Q7Z6K3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTAR1Q7Z6K3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTAR1Q7Z6K3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTAR1Q7Z6K3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTAR1Q7Z6K3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTAR1Q7Z6K3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTAR1Q7Z6K3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms