Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNA2D4Q7Z3S7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNA2D4Q7Z3S7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNA2D4Q7Z3S7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA2D4Q7Z3S7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNA2D4Q7Z3S7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNA2D4Q7Z3S7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms