Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PQLC2Q6ZP29 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PQLC2Q6ZP29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PQLC2Q6ZP29 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PQLC2Q6ZP29 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PQLC2Q6ZP29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms