Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CASC2Q6XLA1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASC2Q6XLA1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASC2Q6XLA1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASC2Q6XLA1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASC2Q6XLA1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms