Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
VSTM1Q6UX27 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VSTM1Q6UX27 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VSTM1Q6UX27 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSTM1Q6UX27 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSTM1Q6UX27 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSTM1Q6UX27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms