Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNIP4Q6PIL6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNIP4Q6PIL6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNIP4Q6PIL6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNIP4Q6PIL6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNIP4Q6PIL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms