Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC27A1Q6PCB7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC27A1Q6PCB7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC27A1Q6PCB7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC27A1Q6PCB7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC27A1Q6PCB7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC27A1Q6PCB7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC27A1Q6PCB7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms