Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1A2

LPCAT3, Lysophospholipid acyltransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3Q6P1A2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPCAT3Q6P1A2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPCAT3Q6P1A2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LPCAT3Q6P1A2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LPCAT3Q6P1A2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LPCAT3Q6P1A2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LPCAT3Q6P1A2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LPCAT3Q6P1A2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LPCAT3Q6P1A2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms