Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDD2Q6NTF9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHBDD2Q6NTF9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDD2Q6NTF9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDD2Q6NTF9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDD2Q6NTF9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDD2Q6NTF9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDD2Q6NTF9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDD2Q6NTF9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDD2Q6NTF9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDD2Q6NTF9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDD2Q6NTF9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms