Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM68Q6AZZ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM68Q6AZZ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM68Q6AZZ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM68Q6AZZ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM68Q6AZZ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM68Q6AZZ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM68Q6AZZ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms