Protein–RNA interactions for Protein: Q643R3

LPCAT4, Lysophospholipid acyltransferase LPCAT4, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4Q643R3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT4Q643R3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LPCAT4Q643R3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LPCAT4Q643R3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LPCAT4Q643R3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT4Q643R3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT4Q643R3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms