Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
YOD1Q5VVQ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
YOD1Q5VVQ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
YOD1Q5VVQ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
YOD1Q5VVQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YOD1Q5VVQ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YOD1Q5VVQ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YOD1Q5VVQ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms