Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIN9Q5TKA1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIN9Q5TKA1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIN9Q5TKA1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LIN9Q5TKA1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LIN9Q5TKA1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LIN9Q5TKA1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms