Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXB2

UBE2NL, Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NLQ5JXB2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE2NLQ5JXB2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2NLQ5JXB2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBE2NLQ5JXB2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE2NLQ5JXB2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
UBE2NLQ5JXB2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2NLQ5JXB2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms