Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NBPF8Q3BBV2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NBPF8Q3BBV2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NBPF8Q3BBV2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NBPF8Q3BBV2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NBPF8Q3BBV2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NBPF8Q3BBV2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NBPF8Q3BBV2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NBPF8Q3BBV2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NBPF8Q3BBV2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NBPF8Q3BBV2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NBPF8Q3BBV2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NBPF8Q3BBV2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NBPF8Q3BBV2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NBPF8Q3BBV2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NBPF8Q3BBV2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms