Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNPY1Q3B7I2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNPY1Q3B7I2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNPY1Q3B7I2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNPY1Q3B7I2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNPY1Q3B7I2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNPY1Q3B7I2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPY1Q3B7I2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNPY1Q3B7I2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY1Q3B7I2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNPY1Q3B7I2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 415.7 ms