Protein–RNA interactions for Protein: Q32M88

PGGHG, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGHGQ32M88 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGGHGQ32M88 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGGHGQ32M88 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PGGHGQ32M88 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PGGHGQ32M88 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PGGHGQ32M88 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGGHGQ32M88 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms