Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA4

CR1L, Complement component receptor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1LQ2VPA4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CR1LQ2VPA4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CR1LQ2VPA4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CR1LQ2VPA4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CR1LQ2VPA4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CR1LQ2VPA4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CR1LQ2VPA4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CR1LQ2VPA4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CR1LQ2VPA4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CR1LQ2VPA4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms