Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ISXQ2M1V0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ISXQ2M1V0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ISXQ2M1V0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ISXQ2M1V0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ISXQ2M1V0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ISXQ2M1V0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms