Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms