Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIP4Q15650 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIP4Q15650 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIP4Q15650 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIP4Q15650 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIP4Q15650 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIP4Q15650 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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