Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAM1Q15629 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAM1Q15629 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAM1Q15629 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAM1Q15629 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAM1Q15629 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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