Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COL19A1Q14993 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL19A1Q14993 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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COL19A1Q14993 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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COL19A1Q14993 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
COL19A1Q14993 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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COL19A1Q14993 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL19A1Q14993 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL19A1Q14993 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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COL19A1Q14993 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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COL19A1Q14993 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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COL19A1Q14993 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
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COL19A1Q14993 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL19A1Q14993 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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COL19A1Q14993 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL19A1Q14993 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL19A1Q14993 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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COL19A1Q14993 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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COL19A1Q14993 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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COL19A1Q14993 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL19A1Q14993 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL19A1Q14993 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL19A1Q14993 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL19A1Q14993 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
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COL19A1Q14993 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL19A1Q14993 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COL19A1Q14993 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL19A1Q14993 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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