Protein–RNA interactions for Protein: Q14940

SLC9A5, Sodium/hydrogen exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A5Q14940 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A5Q14940 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC9A5Q14940 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A5Q14940 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A5Q14940 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A5Q14940 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A5Q14940 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC9A5Q14940 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC9A5Q14940 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A5Q14940 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A5Q14940 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A5Q14940 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A5Q14940 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms