Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CACNA1SQ13698 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CACNA1SQ13698 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CACNA1SQ13698 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CACNA1SQ13698 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CACNA1SQ13698 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CACNA1SQ13698 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CACNA1SQ13698 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CACNA1SQ13698 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CACNA1SQ13698 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CACNA1SQ13698 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CACNA1SQ13698 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CACNA1SQ13698 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CACNA1SQ13698 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CACNA1SQ13698 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CACNA1SQ13698 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CACNA1SQ13698 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
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