Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
NEUROD1Q13562 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NEUROD1Q13562 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NEUROD1Q13562 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NEUROD1Q13562 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NEUROD1Q13562 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NEUROD1Q13562 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NEUROD1Q13562 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NEUROD1Q13562 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEUROD1Q13562 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEUROD1Q13562 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NEUROD1Q13562 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NEUROD1Q13562 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NEUROD1Q13562 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
NEUROD1Q13562 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
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