Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRQ13535 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATRQ13535 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATRQ13535 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRQ13535 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRQ13535 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATRQ13535 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATRQ13535 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRQ13535 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRQ13535 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATRQ13535 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATRQ13535 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATRQ13535 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATRQ13535 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATRQ13535 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATRQ13535 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRQ13535 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATRQ13535 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATRQ13535 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATRQ13535 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATRQ13535 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRQ13535 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATRQ13535 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRQ13535 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATRQ13535 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATRQ13535 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATRQ13535 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATRQ13535 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRQ13535 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRQ13535 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATRQ13535 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRQ13535 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRQ13535 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRQ13535 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRQ13535 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRQ13535 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATRQ13535 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRQ13535 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRQ13535 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRQ13535 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRQ13535 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATRQ13535 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRQ13535 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRQ13535 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATRQ13535 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRQ13535 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATRQ13535 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRQ13535 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRQ13535 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRQ13535 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATRQ13535 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATRQ13535 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRQ13535 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRQ13535 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRQ13535 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATRQ13535 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATRQ13535 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRQ13535 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATRQ13535 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRQ13535 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRQ13535 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRQ13535 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRQ13535 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRQ13535 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATRQ13535 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRQ13535 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRQ13535 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRQ13535 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRQ13535 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRQ13535 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATRQ13535 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATRQ13535 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATRQ13535 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRQ13535 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRQ13535 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRQ13535 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATRQ13535 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRQ13535 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRQ13535 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRQ13535 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRQ13535 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRQ13535 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRQ13535 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATRQ13535 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRQ13535 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRQ13535 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRQ13535 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRQ13535 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRQ13535 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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