Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRSF6Q13247 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SRSF6Q13247 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRSF6Q13247 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRSF6Q13247 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRSF6Q13247 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRSF6Q13247 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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