Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPN13Q12923 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN13Q12923 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN13Q12923 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN13Q12923 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN13Q12923 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN13Q12923 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN13Q12923 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN13Q12923 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPN13Q12923 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN13Q12923 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPN13Q12923 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN13Q12923 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPN13Q12923 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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