Protein–RNA interactions for Protein: Q12241

VAM3, Syntaxin VAM3, yeastyeast

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM3Q12241 MDM35YKL053C-A 261 nt7.7□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 RAS2YNL098C 969 nt7.7□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 THI6YPL214C 1623 nt7.7□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 YHR218WYHR218W 1812 nt7.69□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 YHR219WYHR219W 1875 nt7.69□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 YPI1YFR003C 468 nt7.68□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.68□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.68□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.68□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.68□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 GPN2YOR262W 1044 nt7.68□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 LSB3YFR024C-A 1380 nt7.68□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 SOL2YCR073W-A 948 nt7.67□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 LSB5YCL034W 1065 nt7.67□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 RPD3YNL330C 1302 nt7.67□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 DLD3YEL071W 1491 nt7.67□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 TIM44YIL022W 1296 nt7.66□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 HXT12YIL170W 1374 nt7.66□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 GCD11YER025W 1584 nt7.66□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 MDL2YPL270W 2322 nt7.66□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 TAT2YOL020W 1779 nt7.65□□□□□ -1.18
VAM3Q12241 LSR1LSR1 1175 nt7.64□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 MET8YBR213W 825 nt7.63□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 VRG4YGL225W 1014 nt7.62□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 SNU66YOR308C 1764 nt7.61□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 RPT5YOR117W 1305 nt7.61□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 HXT10YFL011W 1641 nt7.61□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 OYE2YHR179W 1203 nt7.61□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 KRR1YCL059C 951 nt7.6□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 YMR262WYMR262W 942 nt7.6□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 YNR029CYNR029C 1290 nt7.6□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 VMA11YPL234C 495 nt7.6□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 EAF3YPR023C 1206 nt7.6□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 SAM3YPL274W 1764 nt7.6□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 ADE2YOR128C 1716 nt7.59□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 YJL118WYJL118W 660 nt7.59□□□□□ -1.19
VAM3Q12241 YJL055WYJL055W 738 nt7.58□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 ADH1YOL086C 1047 nt7.58□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 TIP1YBR067C 633 nt7.58□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 RIB2YOL066C 1776 nt7.58□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.58□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 ITR2YOL103W 1830 nt7.57□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 LSM5YER146W 282 nt7.56□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 RIB7YBR153W 735 nt7.56□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 YDR455CYDR455C 309 nt7.55□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 MAM3YOL060C 2121 nt7.54□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 RPC31YNL151C 756 nt7.54□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 AGP3YFL055W 1677 nt7.54□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 PCP1YGR101W 1041 nt7.53□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 SNX3YOR357C 489 nt7.53□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 RIM2YBR192W 1134 nt7.53□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 ERG13YML126C 1476 nt7.53□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 TPS1YBR126C 1488 nt7.53□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 GAL3YDR009W 1563 nt7.53□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 ECM10YEL030W 1935 nt7.52□□□□□ -1.2
VAM3Q12241 INH1YDL181W 258 nt7.52□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 YJL195CYJL195C 702 nt7.5□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 NBA1YOL070C 1506 nt7.5□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 DDI1YER143W 1287 nt7.49□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 YOR072WYOR072W 315 nt7.49□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 TMA23YMR269W 636 nt7.48□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 RRT8YOL048C 1029 nt7.48□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 SAC7YDR389W 1965 nt7.48□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 LPD1YFL018C 1500 nt7.47□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 DPL1YDR294C 1770 nt7.47□□□□□ -1.21
VAM3Q12241 FUN14YAL008W 597 nt7.46□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 PAB1YER165W 1734 nt7.46□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 YMR265CYMR265C 1386 nt7.46□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 RPN14YGL004C 1254 nt7.45□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 IMO32YGR031W 1029 nt7.44□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 LEU4YNL104C 1860 nt7.44□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 YNR064CYNR064C 873 nt7.43□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 CCT5YJR064W 1689 nt7.43□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 ELO1YJL196C 933 nt7.42□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 HAP5YOR358W 729 nt7.42□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 YIL177CYIL177C 5277 nt7.42□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 ADE8YDR408C 645 nt7.41□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 YEL008WYEL008W 381 nt7.41□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 YJR114WYJR114W 393 nt7.41□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 DAK2YFL053W 1776 nt7.41□□□□□ -1.22
VAM3Q12241 KEL3YPL263C 1956 nt7.39□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 YDR467CYDR467C 327 nt7.39□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 NAS6YGR232W 687 nt7.39□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 YPR126CYPR126C 309 nt7.38□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 SNZ1YMR096W 894 nt7.37□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 YEL023CYEL023C 2049 nt7.37□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 NPP2YEL016C 1482 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 SUV3YPL029W 2214 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 snR31snR31 225 nt7.36□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 STE4YOR212W 1272 nt7.35□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 MEX67YPL169C 1800 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.34□□□□□ -1.23
VAM3Q12241 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.34□□□□□ -1.23
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