Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 RAD51YER095W 1203 nt7.63□□□□□ -1.19
USB1Q12208 IMO32YGR031W 1029 nt7.63□□□□□ -1.19
USB1Q12208 RRT8YOL048C 1029 nt7.63□□□□□ -1.19
USB1Q12208 YRF1-2YER190W 5046 nt7.62□□□□□ -1.19
USB1Q12208 ERG13YML126C 1476 nt7.62□□□□□ -1.19
USB1Q12208 YDR455CYDR455C 309 nt7.61□□□□□ -1.19
USB1Q12208 DAK2YFL053W 1776 nt7.61□□□□□ -1.19
USB1Q12208 GID8YMR135C 1368 nt7.6□□□□□ -1.19
USB1Q12208 UGP1YKL035W 1500 nt7.59□□□□□ -1.19
USB1Q12208 CPD1YGR247W 720 nt7.59□□□□□ -1.19
USB1Q12208 IML3YBR107C 738 nt7.59□□□□□ -1.19
USB1Q12208 ADH7YCR105W 1086 nt7.58□□□□□ -1.2
USB1Q12208 ADE8YDR408C 645 nt7.58□□□□□ -1.2
USB1Q12208 TAF13YML098W 504 nt7.58□□□□□ -1.2
USB1Q12208 YPR126CYPR126C 309 nt7.57□□□□□ -1.2
USB1Q12208 YJR114WYJR114W 393 nt7.56□□□□□ -1.2
USB1Q12208 YKL133CYKL133C 1392 nt7.56□□□□□ -1.2
USB1Q12208 DLD3YEL071W 1491 nt7.55□□□□□ -1.2
USB1Q12208 SNZ1YMR096W 894 nt7.54□□□□□ -1.2
USB1Q12208 CTI6YPL181W 1521 nt7.53□□□□□ -1.2
USB1Q12208 PAU15YIR041W 375 nt7.53□□□□□ -1.2
USB1Q12208 MHF1YOL086W-A 273 nt7.53□□□□□ -1.2
USB1Q12208 TIP1YBR067C 633 nt7.53□□□□□ -1.2
USB1Q12208 RPD3YNL330C 1302 nt7.52□□□□□ -1.2
USB1Q12208 MRS6YOR370C 1812 nt7.52□□□□□ -1.2
USB1Q12208 ZAP1YJL056C 2643 nt7.52□□□□□ -1.21
USB1Q12208 SPS100YHR139C 981 nt7.52□□□□□ -1.21
USB1Q12208 VMA11YPL234C 495 nt7.52□□□□□ -1.21
USB1Q12208 ACO2YJL200C 2370 nt7.51□□□□□ -1.21
USB1Q12208 YHR219WYHR219W 1875 nt7.51□□□□□ -1.21
USB1Q12208 SAC7YDR389W 1965 nt7.5□□□□□ -1.21
USB1Q12208 TVP23YDR084C 600 nt7.5□□□□□ -1.21
USB1Q12208 YNR064CYNR064C 873 nt7.5□□□□□ -1.21
USB1Q12208 KRR1YCL059C 951 nt7.49□□□□□ -1.21
USB1Q12208 TIM44YIL022W 1296 nt7.49□□□□□ -1.21
USB1Q12208 POT1YIL160C 1254 nt7.49□□□□□ -1.21
USB1Q12208 ITR2YOL103W 1830 nt7.49□□□□□ -1.21
USB1Q12208 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.48□□□□□ -1.21
USB1Q12208 ESS1YJR017C 513 nt7.48□□□□□ -1.21
USB1Q12208 CWP2YKL096W-A 279 nt7.48□□□□□ -1.21
USB1Q12208 LSR1LSR1 1175 nt7.48□□□□□ -1.21
USB1Q12208 YMR209CYMR209C 1374 nt7.47□□□□□ -1.21
USB1Q12208 RPN14YGL004C 1254 nt7.47□□□□□ -1.21
USB1Q12208 KEL3YPL263C 1956 nt7.46□□□□□ -1.21
USB1Q12208 OPI3YJR073C 621 nt7.46□□□□□ -1.22
USB1Q12208 ABZ2YMR289W 1125 nt7.46□□□□□ -1.22
USB1Q12208 ODC1YPL134C 933 nt7.46□□□□□ -1.22
USB1Q12208 MAS1YLR163C 1389 nt7.46□□□□□ -1.22
USB1Q12208 SSL2YIL143C 2532 nt7.45□□□□□ -1.22
USB1Q12208 CYT1YOR065W 930 nt7.45□□□□□ -1.22
USB1Q12208 SNX3YOR357C 489 nt7.45□□□□□ -1.22
USB1Q12208 snR31snR31 225 nt7.45□□□□□ -1.22
USB1Q12208 ELO1YJL196C 933 nt7.44□□□□□ -1.22
USB1Q12208 ENO2YHR174W 1314 nt7.44□□□□□ -1.22
USB1Q12208 DMA2YNL116W 1569 nt7.43□□□□□ -1.22
USB1Q12208 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.43□□□□□ -1.22
USB1Q12208 GSF2YML048W 1212 nt7.43□□□□□ -1.22
USB1Q12208 YMR265CYMR265C 1386 nt7.43□□□□□ -1.22
USB1Q12208 YMR262WYMR262W 942 nt7.42□□□□□ -1.22
USB1Q12208 HAP5YOR358W 729 nt7.42□□□□□ -1.22
USB1Q12208 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.41□□□□□ -1.22
USB1Q12208 MDM35YKL053C-A 261 nt7.41□□□□□ -1.22
USB1Q12208 AMF1YOR378W 1548 nt7.41□□□□□ -1.22
USB1Q12208 STP3YLR375W 1032 nt7.4□□□□□ -1.22
USB1Q12208 YLR173WYLR173W 1827 nt7.39□□□□□ -1.23
USB1Q12208 PCP1YGR101W 1041 nt7.39□□□□□ -1.23
USB1Q12208 RPC31YNL151C 756 nt7.39□□□□□ -1.23
USB1Q12208 GNP1YDR508C 1992 nt7.39□□□□□ -1.23
USB1Q12208 PSD1YNL169C 1503 nt7.38□□□□□ -1.23
USB1Q12208 PGC1YPL206C 966 nt7.38□□□□□ -1.23
USB1Q12208 YBR232CYBR232C 360 nt7.38□□□□□ -1.23
USB1Q12208 TUB4YLR212C 1422 nt7.37□□□□□ -1.23
USB1Q12208 NSG2YNL156C 900 nt7.37□□□□□ -1.23
USB1Q12208 SUV3YPL029W 2214 nt7.37□□□□□ -1.23
USB1Q12208 KRE1YNL322C 942 nt7.36□□□□□ -1.23
USB1Q12208 PAU5YFL020C 369 nt7.35□□□□□ -1.23
USB1Q12208 NAP1YKR048C 1254 nt7.35□□□□□ -1.23
USB1Q12208 LEU2YCL018W 1095 nt7.35□□□□□ -1.23
USB1Q12208 SWT21YNL187W 1074 nt7.34□□□□□ -1.23
USB1Q12208 RIM2YBR192W 1134 nt7.34□□□□□ -1.23
USB1Q12208 TOM71YHR117W 1920 nt7.33□□□□□ -1.24
USB1Q12208 TPC1YGR096W 945 nt7.33□□□□□ -1.24
USB1Q12208 PAR32YDL173W 888 nt7.32□□□□□ -1.24
USB1Q12208 INH1YDL181W 258 nt7.32□□□□□ -1.24
USB1Q12208 CRC1YOR100C 984 nt7.32□□□□□ -1.24
USB1Q12208 MET1YKR069W 1782 nt7.32□□□□□ -1.24
USB1Q12208 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.32□□□□□ -1.24
USB1Q12208 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.32□□□□□ -1.24
USB1Q12208 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.32□□□□□ -1.24
USB1Q12208 NIF3YGL221C 867 nt7.31□□□□□ -1.24
USB1Q12208 SFL1YOR140W 2301 nt7.31□□□□□ -1.24
USB1Q12208 YIL177CYIL177C 5277 nt7.3□□□□□ -1.24
USB1Q12208 SEN2YLR105C 1134 nt7.3□□□□□ -1.24
USB1Q12208 APS2YJR058C 444 nt7.29□□□□□ -1.24
USB1Q12208 TPN1YGL186C 1740 nt7.29□□□□□ -1.24
USB1Q12208 DPL1YDR294C 1770 nt7.28□□□□□ -1.24
USB1Q12208 HXT10YFL011W 1641 nt7.28□□□□□ -1.24
USB1Q12208 FSH2YMR222C 672 nt7.28□□□□□ -1.24
USB1Q12208 SPE2YOL052C 1191 nt7.28□□□□□ -1.24
USB1Q12208 YHR218WYHR218W 1812 nt7.28□□□□□ -1.24
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