Protein–RNA interactions for Protein: Q12039

HMI1, ATP-dependent DNA helicase HMI1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMI1Q12039 ITR2YOL103W 1830 nt9.64□□□□□ -0.87
HMI1Q12039 TMA23YMR269W 636 nt9.64□□□□□ -0.87
HMI1Q12039 YNR029CYNR029C 1290 nt9.64□□□□□ -0.87
HMI1Q12039 RIB7YBR153W 735 nt9.64□□□□□ -0.87
HMI1Q12039 YLR349WYLR349W 507 nt9.62□□□□□ -0.87
HMI1Q12039 DMA2YNL116W 1569 nt9.62□□□□□ -0.87
HMI1Q12039 PSD1YNL169C 1503 nt9.61□□□□□ -0.87
HMI1Q12039 GAL2YLR081W 1725 nt9.59□□□□□ -0.87
HMI1Q12039 GTB1YDR221W 2109 nt9.58□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 SAC7YDR389W 1965 nt9.58□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 URA8YJR103W 1737 nt9.58□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 RPD3YNL330C 1302 nt9.57□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 IMO32YGR031W 1029 nt9.56□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 TIP1YBR067C 633 nt9.56□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 YEL008WYEL008W 381 nt9.55□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 TIM44YIL022W 1296 nt9.55□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 CSM2YIL132C 642 nt9.55□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 ACO2YJL200C 2370 nt9.55□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 ADH7YCR105W 1086 nt9.54□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 RFC1YOR217W 2586 nt9.54□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 MDM35YKL053C-A 261 nt9.53□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 CWP2YKL096W-A 279 nt9.53□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 RRT8YOL048C 1029 nt9.53□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 CYT1YOR065W 930 nt9.53□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 VMA11YPL234C 495 nt9.53□□□□□ -0.88
HMI1Q12039 ADE8YDR408C 645 nt9.51□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 PAU15YIR041W 375 nt9.51□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 ELO1YJL196C 933 nt9.5□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 SNZ1YMR096W 894 nt9.5□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 HEM14YER014W 1620 nt9.49□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 YHR218WYHR218W 1812 nt9.49□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 DAK2YFL053W 1776 nt9.48□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.48□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 HXT10YFL011W 1641 nt9.48□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 YJR114WYJR114W 393 nt9.47□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 SNX3YOR357C 489 nt9.47□□□□□ -0.89
HMI1Q12039 YNR064CYNR064C 873 nt9.46□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 CPD1YGR247W 720 nt9.45□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 OPI3YJR073C 621 nt9.45□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 YMR262WYMR262W 942 nt9.45□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 RPC31YNL151C 756 nt9.44□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 YPR126CYPR126C 309 nt9.43□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 TOK1YJL093C 2076 nt9.43□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 YMR265CYMR265C 1386 nt9.41□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 RIM2YBR192W 1134 nt9.41□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 DPL1YDR294C 1770 nt9.41□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 CCT5YJR064W 1689 nt9.4□□□□□ -0.9
HMI1Q12039 SUV3YPL029W 2214 nt9.39□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 HAP5YOR358W 729 nt9.39□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 THI72YOR192C 1800 nt9.38□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 KEL3YPL263C 1956 nt9.37□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 YHL008CYHL008C 1884 nt9.37□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 TVP23YDR084C 600 nt9.37□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 CTI6YPL181W 1521 nt9.36□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 SPS100YHR139C 981 nt9.36□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 AGP3YFL055W 1677 nt9.36□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 SFL1YOR140W 2301 nt9.34□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 LEU4YNL104C 1860 nt9.34□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.34□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 IML3YBR107C 738 nt9.34□□□□□ -0.91
HMI1Q12039 ESS1YJR017C 513 nt9.33□□□□□ -0.92
HMI1Q12039 CRC1YOR100C 984 nt9.33□□□□□ -0.92
HMI1Q12039 KRR1YCL059C 951 nt9.32□□□□□ -0.92
HMI1Q12039 RPN14YGL004C 1254 nt9.32□□□□□ -0.92
HMI1Q12039 MET1YKR069W 1782 nt9.3□□□□□ -0.92
HMI1Q12039 ABZ2YMR289W 1125 nt9.3□□□□□ -0.92
HMI1Q12039 SWT21YNL187W 1074 nt9.3□□□□□ -0.92
HMI1Q12039 INH1YDL181W 258 nt9.27□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 YDR467CYDR467C 327 nt9.27□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 ENO2YHR174W 1314 nt9.27□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 snR31snR31 225 nt9.26□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 PCP1YGR101W 1041 nt9.25□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 YKL053WYKL053W 375 nt9.25□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 AMF1YOR378W 1548 nt9.25□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 NPP2YEL016C 1482 nt9.24□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 MHF1YOL086W-A 273 nt9.24□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 PAU21YOR394W 495 nt9.23□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 PAU22YPL282C 495 nt9.23□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 KGD2YDR148C 1392 nt9.23□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 RSC4YKR008W 1878 nt9.22□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.22□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.22□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 PAU5YFL020C 369 nt9.22□□□□□ -0.93
HMI1Q12039 TPC1YGR096W 945 nt9.21□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 TAF13YML098W 504 nt9.21□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 NBA1YOL070C 1506 nt9.21□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 POT1YIL160C 1254 nt9.19□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 PGC1YPL206C 966 nt9.19□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 GPM1YKL152C 744 nt9.18□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 STP3YLR375W 1032 nt9.17□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 SEN2YLR105C 1134 nt9.16□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 FRA1YLL029W 2250 nt9.15□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 ARO7YPR060C 771 nt9.15□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 YBR232CYBR232C 360 nt9.15□□□□□ -0.94
HMI1Q12039 FET5YFL041W 1869 nt9.15□□□□□ -0.95
HMI1Q12039 SAN1YDR143C 1833 nt9.15□□□□□ -0.95
HMI1Q12039 THI3YDL080C 1830 nt9.14□□□□□ -0.95
HMI1Q12039 NAP1YKR048C 1254 nt9.13□□□□□ -0.95
HMI1Q12039 YBL095WYBL095W 813 nt9.13□□□□□ -0.95
HMI1Q12039 NAM8YHR086W 1572 nt9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.5 ms