Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 312.17□□□□□ -0.463e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.633e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 ANTXR2-201ENST00000307333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.843e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.073e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.23e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 ANTXR2-205ENST00000449651 2026 ntTSL 26.49□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.573e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 55.17□□□□□ -1.583e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-204ENST00000480904 493 ntTSL 34.75□□□□□ -1.653e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.653e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-214ENST00000521267 851 ntTSL 34.06□□□□□ -1.763e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-211ENST00000520396 550 ntTSL 34.06□□□□□ -1.763e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)4.01□□□□□ -1.773e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 33.74□□□□□ -1.813e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 53.4□□□□□ -1.873e-9■■■■■ 29.2
SRSF1Q07955 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 29.1
SRSF1Q07955 RRM2-210ENST00000498343 560 ntTSL 211.09□□□□□ -0.631e-10■■■■■ 29
SRSF1Q07955 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.68e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.423e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-204ENST00000460668 842 ntTSL 322.85■■□□□ 1.253e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-212ENST00000496977 983 ntTSL 522.85■■□□□ 1.253e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 TCAM1P-203ENST00000469014 478 ntTSL 222.08■■□□□ 1.133e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-210ENST00000487411 1290 ntTSL 1 (best)21.1■□□□□ 0.973e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-215ENST00000565483 846 ntTSL 521.06■□□□□ 0.965e-11■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-216ENST00000566353 696 ntTSL 220.7■□□□□ 0.95e-11■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-203ENST00000457779 571 ntTSL 320.58■□□□□ 0.895e-11■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-205ENST00000461455 1002 ntTSL 218.88■□□□□ 0.615e-11■■■■■ 29
SRSF1Q07955 STX4-211ENST00000493902 1588 ntTSL 518.75■□□□□ 0.593e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 SLC25A16-204ENST00000491102 538 ntTSL 418.46■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 SLC25A16-205ENST00000493963 1121 ntTSL 1 (best)17.92■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 LMBR1-206ENST00000430825 1208 ntTSL 517.35■□□□□ 0.373e-8■■■■■ 29
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SRSF1Q07955 LMBR1-220ENST00000609081 466 ntTSL 314.14□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.133e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 29
SRSF1Q07955 CASP8AP2-203ENST00000547893 2003 ntTSL 515.72■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 28.9
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SRSF1Q07955 CASP8AP2-204ENST00000548224 1300 ntTSL 513.05□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 NUP107-205ENST00000535718 2655 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.12e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.282e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 NUP107-204ENST00000535333 683 ntTSL 36.96□□□□□ -1.32e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 CASP8AP2-201ENST00000237177 6719 ntTSL 56.09□□□□□ -1.432e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 NUP107-206ENST00000537598 695 ntTSL 35.83□□□□□ -1.482e-9■■■■■ 28.9
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SRSF1Q07955 CASP8AP2-206ENST00000552401 1153 ntTSL 1 (best)4.59□□□□□ -1.672e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 NUP107-208ENST00000538549 678 ntTSL 54.44□□□□□ -1.72e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 NUP107-213ENST00000545140 516 ntTSL 23.78□□□□□ -1.82e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-13■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 55.18□□□□□ -1.581e-13■■■■■ 28.9
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SRSF1Q07955 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.176e-9■■■■■ 28.9
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SRSF1Q07955 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 28.9
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SRSF1Q07955 TCEA1-204ENST00000518784 586 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.076e-9■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-203ENST00000501869 684 ntTSL 1 (best)17.58■□□□□ 0.44e-11■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-205ENST00000504769 548 ntTSL 416.1■□□□□ 0.174e-11■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.174e-11■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-11■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-210ENST00000510087 590 ntTSL 314.24□□□□□ -0.134e-11■■■■■ 28.9
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SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-11■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-201ENST00000496733 409 ntTSL 39.15□□□□□ -0.944e-11■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.654e-11■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 TMEM161B-AS1-211ENST00000512724 570 ntTSL 34.21□□□□□ -1.744e-11■■■■■ 28.9
SRSF1Q07955 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.775e-19■■■■■ 28.8
SRSF1Q07955 CCDC14-204ENST00000417438 548 ntTSL 416.05■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-209ENST00000435910 864 ntTSL 314.64□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-214ENST00000478956 555 ntTSL 412.97□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-213ENST00000477268 589 ntTSL 412.64□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-211ENST00000463996 374 ntTSL 211.58□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-210ENST00000438440 783 ntTSL 311.52□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.764e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-201ENST00000310351 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-207ENST00000433542 3260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-203ENST00000409697 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-222ENST00000495381 3993 ntTSL 27.58□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-216ENST00000483247 697 ntTSL 36.24□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 CCDC14-202ENST00000409657 3815 ntTSL 24.33□□□□□ -1.724e-7■■■■■ 28.7
SRSF1Q07955 LUC7L-209ENST00000429378 721 ntTSL 317.56■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 28.6
SRSF1Q07955 IPO4-215ENST00000560935 701 ntTSL 318.81■□□□□ 0.63e-9■■■■■ 28.4
SRSF1Q07955 POLR1B-214ENST00000496238 587 ntTSL 417.87■□□□□ 0.453e-9■■■■■ 28.4
SRSF1Q07955 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 28.4
SRSF1Q07955 IPO4-219ENST00000561379 624 ntTSL 414.68□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 28.4
SRSF1Q07955 IPO4-205ENST00000558233 1015 ntTSL 514.68□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 28.4
SRSF1Q07955 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.143e-9■■■■■ 28.4
SRSF1Q07955 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 28.4
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