Protein–RNA interactions for Protein: Q06071

BLS1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit BLS1, yeastyeast

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BLS1Q06071 ENT4YLL038C 744 nt8.75□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 YLR046CYLR046C 813 nt8.75□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 YPR126CYPR126C 309 nt8.75□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 IML3YBR107C 738 nt8.75□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 RIM8YGL045W 1629 nt8.75□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 GID8YMR135C 1368 nt8.74□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 UGP1YKL035W 1500 nt8.74□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 ESS1YJR017C 513 nt8.73□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 CTI6YPL181W 1521 nt8.72□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 MHF1YOL086W-A 273 nt8.72□□□□□ -1.01
BLS1Q06071 PAU5YFL020C 369 nt8.71□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 RRT8YOL048C 1029 nt8.71□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 POT1YIL160C 1254 nt8.7□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 PAB1YER165W 1734 nt8.7□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 YGL114WYGL114W 2178 nt8.69□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 MRS6YOR370C 1812 nt8.69□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 ADE8YDR408C 645 nt8.69□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 YMR262WYMR262W 942 nt8.69□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 ZAP1YJL056C 2643 nt8.68□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 YKL133CYKL133C 1392 nt8.68□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 DLD3YEL071W 1491 nt8.68□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 SAC7YDR389W 1965 nt8.68□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.67□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 YHR219WYHR219W 1875 nt8.66□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 STP3YLR375W 1032 nt8.65□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 ITR2YOL103W 1830 nt8.65□□□□□ -1.02
BLS1Q06071 SPS100YHR139C 981 nt8.64□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 YJR114WYJR114W 393 nt8.64□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 GSF2YML048W 1212 nt8.64□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 LSR1LSR1 1175 nt8.64□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 DTR1YBR180W 1719 nt8.63□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 PGC1YPL206C 966 nt8.63□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 OPI3YJR073C 621 nt8.6□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 YNR064CYNR064C 873 nt8.6□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 TIP1YBR067C 633 nt8.6□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 TVP23YDR084C 600 nt8.59□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 ELO1YJL196C 933 nt8.59□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 TUB4YLR212C 1422 nt8.59□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 YMR209CYMR209C 1374 nt8.59□□□□□ -1.03
BLS1Q06071 NAS6YGR232W 687 nt8.58□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 SEN2YLR105C 1134 nt8.58□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 VMA11YPL234C 495 nt8.58□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 RPD3YNL330C 1302 nt8.57□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 ABZ2YMR289W 1125 nt8.57□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 ODC1YPL134C 933 nt8.57□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 YBR232CYBR232C 360 nt8.57□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 SSL2YIL143C 2532 nt8.57□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 PAR32YDL173W 888 nt8.56□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 KRE1YNL322C 942 nt8.56□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 ENO2YHR174W 1314 nt8.55□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 GNP1YDR508C 1992 nt8.55□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 APS2YJR058C 444 nt8.55□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 ILV2YMR108W 2064 nt8.53□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 NAP1YKR048C 1254 nt8.53□□□□□ -1.04
BLS1Q06071 NIF3YGL221C 867 nt8.52□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 TIM44YIL022W 1296 nt8.52□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 SNX3YOR357C 489 nt8.52□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 KEL3YPL263C 1956 nt8.52□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 CWP2YKL096W-A 279 nt8.51□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 YMR265CYMR265C 1386 nt8.49□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 HEL2YDR266C 1920 nt8.49□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 HAP5YOR358W 729 nt8.49□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 SUV3YPL029W 2214 nt8.49□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 AMF1YOR378W 1548 nt8.48□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 DMA2YNL116W 1569 nt8.48□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 PCP1YGR101W 1041 nt8.47□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 SFL1YOR140W 2301 nt8.47□□□□□ -1.05
BLS1Q06071 RPN14YGL004C 1254 nt8.46□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 YJL064WYJL064W 396 nt8.46□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 SWT21YNL187W 1074 nt8.46□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 IGD1YFR017C 588 nt8.45□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 TPC1YGR096W 945 nt8.45□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 MDM35YKL053C-A 261 nt8.45□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 SPE2YOL052C 1191 nt8.45□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 MET1YKR069W 1782 nt8.44□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 RPC31YNL151C 756 nt8.44□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 snR31snR31 225 nt8.44□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 CRC1YOR100C 984 nt8.43□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 PAU19YMR325W 375 nt8.42□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 PSD1YNL169C 1503 nt8.42□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 KRR1YCL059C 951 nt8.41□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 LEU2YCL018W 1095 nt8.41□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 RIM2YBR192W 1134 nt8.4□□□□□ -1.06
BLS1Q06071 THP3YPR045C 1413 nt8.39□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 YKL053WYKL053W 375 nt8.39□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 CYT1YOR065W 930 nt8.39□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 DPL1YDR294C 1770 nt8.39□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 RFC1YOR217W 2586 nt8.39□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 NAS2YIL007C 663 nt8.38□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 FSH2YMR222C 672 nt8.38□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 PUP1YOR157C 786 nt8.38□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 NAM8YHR086W 1572 nt8.36□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 HXT10YFL011W 1641 nt8.36□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 YHR218WYHR218W 1812 nt8.34□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 YKR012CYKR012C 378 nt8.34□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 KGD2YDR148C 1392 nt8.34□□□□□ -1.07
BLS1Q06071 YCR025CYCR025C 411 nt8.33□□□□□ -1.08
BLS1Q06071 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.33□□□□□ -1.08
BLS1Q06071 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.33□□□□□ -1.08
BLS1Q06071 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms