Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
EXOSC10Q01780 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
EXOSC10Q01780 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
EXOSC10Q01780 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EXOSC10Q01780 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
EXOSC10Q01780 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
EXOSC10Q01780 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EXOSC10Q01780 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms