Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GALK2Q01415 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GALK2Q01415 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GALK2Q01415 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GALK2Q01415 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALK2Q01415 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALK2Q01415 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GALK2Q01415 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALK2Q01415 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALK2Q01415 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALK2Q01415 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALK2Q01415 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALK2Q01415 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GALK2Q01415 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms