Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM193AP78312 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
FAM193AP78312 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM193AP78312 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM193AP78312 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM193AP78312 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM193AP78312 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM193AP78312 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM193AP78312 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM193AP78312 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM193AP78312 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM193AP78312 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM193AP78312 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM193AP78312 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM193AP78312 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM193AP78312 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM193AP78312 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM193AP78312 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM193AP78312 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM193AP78312 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM193AP78312 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM193AP78312 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1337.4 ms