Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
UBXN2AP68543 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UBXN2AP68543 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UBXN2AP68543 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBXN2AP68543 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
UBXN2AP68543 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBXN2AP68543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN2AP68543 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms