Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS16P62249 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS16P62249 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS16P62249 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS16P62249 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS16P62249 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS16P62249 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS16P62249 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS16P62249 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS16P62249 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS16P62249 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS16P62249 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS16P62249 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS16P62249 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS16P62249 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS16P62249 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS16P62249 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS16P62249 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS16P62249 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS16P62249 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPS16P62249 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS16P62249 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS16P62249 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS16P62249 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS16P62249 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS16P62249 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPS16P62249 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS16P62249 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS16P62249 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPS16P62249 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS16P62249 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS16P62249 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS16P62249 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS16P62249 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS16P62249 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS16P62249 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS16P62249 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS16P62249 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS16P62249 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS16P62249 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS16P62249 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS16P62249 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS16P62249 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS16P62249 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS16P62249 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS16P62249 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS16P62249 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS16P62249 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS16P62249 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS16P62249 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS16P62249 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS16P62249 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS16P62249 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS16P62249 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS16P62249 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS16P62249 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS16P62249 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS16P62249 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS16P62249 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS16P62249 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS16P62249 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS16P62249 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS16P62249 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS16P62249 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS16P62249 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS16P62249 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS16P62249 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS16P62249 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS16P62249 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS16P62249 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS16P62249 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS16P62249 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS16P62249 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS16P62249 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS16P62249 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS16P62249 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS16P62249 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS16P62249 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS16P62249 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS16P62249 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS16P62249 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS16P62249 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS16P62249 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS16P62249 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS16P62249 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS16P62249 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS16P62249 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS16P62249 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS16P62249 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS16P62249 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS16P62249 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS16P62249 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS16P62249 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS16P62249 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS16P62249 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS16P62249 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS16P62249 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS16P62249 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS16P62249 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS16P62249 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms