Protein–RNA interactions for Protein: P61278

SST, Somatostatin, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSTP61278 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSTP61278 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSTP61278 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSTP61278 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSTP61278 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSTP61278 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SSTP61278 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSTP61278 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSTP61278 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSTP61278 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSTP61278 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSTP61278 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSTP61278 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SSTP61278 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSTP61278 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSTP61278 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSTP61278 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSTP61278 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSTP61278 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSTP61278 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSTP61278 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSTP61278 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSTP61278 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSTP61278 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSTP61278 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSTP61278 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSTP61278 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSTP61278 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSTP61278 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSTP61278 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSTP61278 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSTP61278 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSTP61278 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSTP61278 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSTP61278 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSTP61278 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSTP61278 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSTP61278 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSTP61278 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSTP61278 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSTP61278 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSTP61278 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSTP61278 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSTP61278 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSTP61278 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSTP61278 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSTP61278 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSTP61278 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSTP61278 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSTP61278 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSTP61278 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSTP61278 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSTP61278 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSTP61278 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSTP61278 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSTP61278 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSTP61278 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSTP61278 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSTP61278 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSTP61278 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSTP61278 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSTP61278 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSTP61278 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSTP61278 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSTP61278 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSTP61278 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSTP61278 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSTP61278 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSTP61278 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSTP61278 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSTP61278 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSTP61278 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSTP61278 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSTP61278 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSTP61278 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSTP61278 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSTP61278 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSTP61278 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSTP61278 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSTP61278 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSTP61278 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSTP61278 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSTP61278 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSTP61278 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSTP61278 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SSTP61278 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSTP61278 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSTP61278 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSTP61278 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSTP61278 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSTP61278 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSTP61278 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSTP61278 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSTP61278 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSTP61278 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSTP61278 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSTP61278 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSTP61278 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSTP61278 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSTP61278 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms