Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MCCD1P59942 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MCCD1P59942 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCCD1P59942 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCCD1P59942 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCCD1P59942 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MCCD1P59942 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms