Protein–RNA interactions for Protein: P59827

BPIFB4, BPI fold-containing family B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB4P59827 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFB4P59827 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BPIFB4P59827 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BPIFB4P59827 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BPIFB4P59827 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
BPIFB4P59827 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
BPIFB4P59827 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms