Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP1S2P56377 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP1S2P56377 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP1S2P56377 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AP1S2P56377 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AP1S2P56377 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP1S2P56377 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms