Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TPTEP56180 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TPTEP56180 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPTEP56180 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPTEP56180 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TPTEP56180 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPTEP56180 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPTEP56180 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TPTEP56180 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPTEP56180 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TPTEP56180 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPTEP56180 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TPTEP56180 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPTEP56180 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPTEP56180 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPTEP56180 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TPTEP56180 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TPTEP56180 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPTEP56180 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPTEP56180 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPTEP56180 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPTEP56180 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TPTEP56180 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPTEP56180 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPTEP56180 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPTEP56180 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TPTEP56180 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TPTEP56180 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPTEP56180 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPTEP56180 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPTEP56180 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPTEP56180 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TPTEP56180 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPTEP56180 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TPTEP56180 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TPTEP56180 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPTEP56180 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPTEP56180 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPTEP56180 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPTEP56180 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPTEP56180 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPTEP56180 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPTEP56180 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPTEP56180 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPTEP56180 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPTEP56180 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPTEP56180 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPTEP56180 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPTEP56180 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPTEP56180 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TPTEP56180 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPTEP56180 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPTEP56180 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPTEP56180 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPTEP56180 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPTEP56180 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPTEP56180 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPTEP56180 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPTEP56180 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPTEP56180 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPTEP56180 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPTEP56180 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPTEP56180 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TPTEP56180 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPTEP56180 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPTEP56180 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPTEP56180 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPTEP56180 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPTEP56180 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPTEP56180 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPTEP56180 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPTEP56180 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPTEP56180 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPTEP56180 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPTEP56180 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPTEP56180 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPTEP56180 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPTEP56180 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPTEP56180 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPTEP56180 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPTEP56180 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTEP56180 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPTEP56180 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTEP56180 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTEP56180 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTEP56180 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPTEP56180 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTEP56180 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTEP56180 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPTEP56180 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTEP56180 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPTEP56180 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms