Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX1P55347 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX1P55347 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX1P55347 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PKNOX1P55347 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PKNOX1P55347 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PKNOX1P55347 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKNOX1P55347 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKNOX1P55347 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKNOX1P55347 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKNOX1P55347 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PKNOX1P55347 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms