Protein–RNA interactions for Protein: P55287

CDH11, Cadherin-11, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH11P55287 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH11P55287 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH11P55287 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH11P55287 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH11P55287 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH11P55287 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH11P55287 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH11P55287 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH11P55287 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH11P55287 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH11P55287 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH11P55287 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH11P55287 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH11P55287 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH11P55287 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH11P55287 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH11P55287 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH11P55287 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH11P55287 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH11P55287 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH11P55287 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH11P55287 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH11P55287 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH11P55287 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH11P55287 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH11P55287 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH11P55287 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH11P55287 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH11P55287 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH11P55287 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH11P55287 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH11P55287 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH11P55287 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH11P55287 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH11P55287 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH11P55287 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH11P55287 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH11P55287 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH11P55287 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDH11P55287 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH11P55287 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH11P55287 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDH11P55287 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH11P55287 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH11P55287 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH11P55287 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH11P55287 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH11P55287 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDH11P55287 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH11P55287 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH11P55287 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH11P55287 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDH11P55287 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH11P55287 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH11P55287 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDH11P55287 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH11P55287 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDH11P55287 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH11P55287 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH11P55287 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH11P55287 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDH11P55287 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH11P55287 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH11P55287 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDH11P55287 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDH11P55287 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDH11P55287 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH11P55287 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH11P55287 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH11P55287 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH11P55287 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH11P55287 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH11P55287 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH11P55287 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH11P55287 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH11P55287 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH11P55287 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH11P55287 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH11P55287 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH11P55287 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH11P55287 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH11P55287 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH11P55287 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH11P55287 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH11P55287 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH11P55287 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH11P55287 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH11P55287 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH11P55287 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH11P55287 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH11P55287 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH11P55287 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH11P55287 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH11P55287 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH11P55287 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH11P55287 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH11P55287 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH11P55287 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH11P55287 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH11P55287 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms