Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NR1H2P55055 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H2P55055 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H2P55055 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NR1H2P55055 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NR1H2P55055 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR1H2P55055 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR1H2P55055 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms