Protein–RNA interactions for Protein: P54851

EMP2, Epithelial membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP2P54851 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMP2P54851 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMP2P54851 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EMP2P54851 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMP2P54851 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EMP2P54851 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMP2P54851 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EMP2P54851 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP2P54851 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP2P54851 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP2P54851 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMP2P54851 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EMP2P54851 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMP2P54851 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMP2P54851 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMP2P54851 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMP2P54851 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMP2P54851 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMP2P54851 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMP2P54851 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMP2P54851 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMP2P54851 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMP2P54851 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP2P54851 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMP2P54851 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EMP2P54851 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMP2P54851 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMP2P54851 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMP2P54851 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMP2P54851 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMP2P54851 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMP2P54851 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMP2P54851 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMP2P54851 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMP2P54851 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMP2P54851 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMP2P54851 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMP2P54851 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMP2P54851 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMP2P54851 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMP2P54851 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMP2P54851 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EMP2P54851 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMP2P54851 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMP2P54851 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMP2P54851 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMP2P54851 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMP2P54851 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMP2P54851 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP2P54851 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP2P54851 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP2P54851 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EMP2P54851 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMP2P54851 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EMP2P54851 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMP2P54851 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP2P54851 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EMP2P54851 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP2P54851 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP2P54851 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP2P54851 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EMP2P54851 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMP2P54851 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMP2P54851 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMP2P54851 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP2P54851 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP2P54851 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP2P54851 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP2P54851 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP2P54851 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP2P54851 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EMP2P54851 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP2P54851 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP2P54851 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP2P54851 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMP2P54851 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EMP2P54851 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMP2P54851 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMP2P54851 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMP2P54851 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMP2P54851 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMP2P54851 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMP2P54851 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMP2P54851 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP2P54851 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP2P54851 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP2P54851 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMP2P54851 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP2P54851 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP2P54851 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP2P54851 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMP2P54851 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP2P54851 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP2P54851 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP2P54851 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP2P54851 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMP2P54851 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMP2P54851 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMP2P54851 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EMP2P54851 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms